MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017809	AAG	3	9	68	76	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858948
2	NC_017809	AAG	2	6	106	111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858948
3	NC_017809	GAG	2	6	118	123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858948
4	NC_017809	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858948
5	NC_017809	AGATA	2	10	141	150	60 %	20 %	20 %	0 %	386858948
6	NC_017809	GAAG	2	8	162	169	50 %	0 %	50 %	0 %	386858948
7	NC_017809	GTG	2	6	185	190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858948
8	NC_017809	CAG	2	6	239	244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858948
9	NC_017809	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858948
10	NC_017809	AGGG	2	8	306	313	25 %	0 %	75 %	0 %	386858948
11	NC_017809	AAGA	2	8	349	356	75 %	0 %	25 %	0 %	386858948
12	NC_017809	GTT	2	6	366	371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858948
13	NC_017809	TAC	3	9	372	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858948
14	NC_017809	AGC	4	12	414	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858948
15	NC_017809	GCA	2	6	529	534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858948
16	NC_017809	AAGA	2	8	565	572	75 %	0 %	25 %	0 %	386858948
17	NC_017809	A	7	7	591	597	100 %	0 %	0 %	0 %	386858948
18	NC_017809	GGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858948
19	NC_017809	AGG	2	6	642	647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858948
20	NC_017809	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858948
21	NC_017809	ATG	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858948
22	NC_017809	ATAA	2	8	781	788	75 %	25 %	0 %	0 %	386858948
23	NC_017809	GA	3	6	797	802	50 %	0 %	50 %	0 %	386858948
24	NC_017809	TAAT	2	8	840	847	50 %	50 %	0 %	0 %	386858948
25	NC_017809	TA	4	8	859	866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017809	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017809	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017809	TAG	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017809	AG	3	6	902	907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017809	CT	3	6	920	925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017809	T	7	7	925	931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017809	T	8	8	950	957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017809	N	969	969	976	1944	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017809	TGA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017809	ACT	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017809	GCT	3	9	1991	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
37	NC_017809	TGG	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858949
38	NC_017809	TAG	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858949
39	NC_017809	AGT	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858949
40	NC_017809	TAA	2	6	2107	2112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858949
41	NC_017809	TGC	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
42	NC_017809	ATT	2	6	2167	2172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858949
43	NC_017809	CTG	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
44	NC_017809	AAAG	2	8	2212	2219	75 %	0 %	25 %	0 %	386858949
45	NC_017809	GCA	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858949
46	NC_017809	AGG	2	6	2245	2250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858949
47	NC_017809	AT	3	6	2265	2270	50 %	50 %	0 %	0 %	386858949
48	NC_017809	CTA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858949
49	NC_017809	GTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858949
50	NC_017809	GCGA	2	8	2383	2390	25 %	0 %	50 %	25 %	386858949
51	NC_017809	GGT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858949
52	NC_017809	CTG	2	6	2421	2426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858949
53	NC_017809	ATG	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858949
54	NC_017809	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858949
55	NC_017809	TGT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858949
56	NC_017809	TAA	3	9	2620	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017809	ATA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017809	ATAA	2	8	2654	2661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017809	T	8	8	2703	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017809	TAAA	2	8	2718	2725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017809	TATT	2	8	2726	2733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017809	TGT	2	6	2738	2743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017809	ATT	2	6	2756	2761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017809	TTTG	2	8	2764	2771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017809	TTA	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017809	A	7	7	2811	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	386858950
67	NC_017809	AGAA	2	8	2820	2827	75 %	0 %	25 %	0 %	386858950
68	NC_017809	AAT	2	6	2835	2840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858950
69	NC_017809	TGA	4	12	2843	2854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
70	NC_017809	G	7	7	2875	2881	0 %	0 %	100 %	0 %	386858950
71	NC_017809	AGG	4	12	2901	2912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
72	NC_017809	ATG	2	6	2938	2943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
73	NC_017809	GAG	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
74	NC_017809	AGA	2	6	3032	3037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
75	NC_017809	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858950
76	NC_017809	AAG	2	6	3070	3075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
77	NC_017809	AGA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
78	NC_017809	TAA	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858950
79	NC_017809	A	6	6	3150	3155	100 %	0 %	0 %	0 %	386858950
80	NC_017809	TAAT	2	8	3170	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	386858950
81	NC_017809	TAG	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
82	NC_017809	GCA	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
83	NC_017809	GAT	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
84	NC_017809	ATTGA	2	10	3295	3304	40 %	40 %	20 %	0 %	386858950
85	NC_017809	A	6	6	3304	3309	100 %	0 %	0 %	0 %	386858950
86	NC_017809	AAG	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
87	NC_017809	ATA	2	6	3407	3412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858950
88	NC_017809	TGC	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858950
89	NC_017809	CAG	3	9	3455	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
90	NC_017809	AGC	3	9	3477	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
91	NC_017809	AAC	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858950
92	NC_017809	GTGG	2	8	3499	3506	0 %	25 %	75 %	0 %	386858950
93	NC_017809	GCT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858950
94	NC_017809	AAC	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858950
95	NC_017809	AGC	3	9	3642	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
96	NC_017809	AGG	2	6	3705	3710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
97	NC_017809	AGG	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858950
98	NC_017809	AGA	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
99	NC_017809	AAAT	2	8	3768	3775	75 %	25 %	0 %	0 %	386858950
100	NC_017809	TAG	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858950
101	NC_017809	AGA	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
102	NC_017809	AAG	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858950
103	NC_017809	CAG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858950
104	NC_017809	TCA	2	6	3888	3893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017809	GAT	2	6	3898	3903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017809	AT	3	6	3907	3912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017809	TAA	2	6	3926	3931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017809	AT	3	6	3975	3980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017809	AGA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017809	ATTTA	2	10	3997	4006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017809	AT	3	6	4016	4021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017809	TG	3	6	4059	4064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017809	T	7	7	4065	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017809	T	6	6	4077	4082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017809	TGT	2	6	4094	4099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017809	AGA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017809	A	7	7	4150	4156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017809	GA	3	6	4164	4169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017809	AAG	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017809	AG	3	6	4175	4180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017809	AAG	2	6	4186	4191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017809	TGA	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017809	ATG	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858951
124	NC_017809	GTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858951
125	NC_017809	TAA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858951
126	NC_017809	AG	3	6	4267	4272	50 %	0 %	50 %	0 %	386858951
127	NC_017809	TGG	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858951
128	NC_017809	AGT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858951
129	NC_017809	TAG	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017809	AAG	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017809	TAA	2	6	4463	4468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858952
132	NC_017809	TTG	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858952
133	NC_017809	GAAG	2	8	4484	4491	50 %	0 %	50 %	0 %	386858952
134	NC_017809	AGATA	2	10	4553	4562	60 %	20 %	20 %	0 %	386858952
135	NC_017809	TTG	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858952
136	NC_017809	ACTT	2	8	4612	4619	25 %	50 %	0 %	25 %	386858952
137	NC_017809	TGG	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858952
138	NC_017809	TGT	2	6	4649	4654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858952
139	NC_017809	TAG	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858952
140	NC_017809	AAG	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858952
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.